古城等人解决了本土的圣歼派事件，并回到弦神岛，但当他们到达时，却接连发生原因不明的船舶事故和飞机失事，导致弦神岛陷入孤立状态。雪菜推测这一异常事态的原因可能是风水术引发的军事术式，而那月则猜想到了能够操纵如此规模术式的术士人选。那月所说出的，乃是魔导恐怖组织“深渊之陷”。而他们下一次发动的恐怖袭击的目的是——！？“消失的圣枪篇”在新的波折的预感面前，幕间的故事——佯围绕着“圣歼”和瓦特拉的战斗中取得胜利的古城和雪菜。　　虽然已经把弦神岛作为自己的“夜之帝国”而成为实质性的岛屿支配者的古城，却过着与以前一成不变的日常生活。　　但就在此时，弦神岛周边海域发生的原因不明的海难事故，由狮子王机关和太史局进 行联合调查。　　另一方面，古城被呼叫自己的声音唤醒。映入记忆模糊的他视线中的景象，是脸颊通红地蜷缩在自己睡的那张毛毯中，流着泪哭诉着的雪菜的容貌。　　“前辈……我重要的东西不见了……”